स्वच्छ विद्यालय और हरित विद्यालय पुरस्कार शैक्षणिक सत्र 2016-17 से केंद्रीय विद्यालय में स्वच्छ और हरित वातावरण पर जोर देने के लिए शुरू किए गए।
प्रत्येक क्षेत्र में तीन केन्द्रीय विद्यालयो को ट्राफियों और नकद पुरस्कार के साथ सालाना सम्मानित किया जाता है।